Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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