Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms