Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD4L3Q6VB84 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD4L3Q6VB84 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms