Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms