Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms