Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP188Q5SRE5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms