Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms