Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms