Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA8Q53HL2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms