Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms