Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms