Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTDC1Q4AE62 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms