Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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