Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms