Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms