Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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