Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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