Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK5Q16478 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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