Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CST6Q15828 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CST6Q15828 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms