Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITSN1Q15811 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITSN1Q15811 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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