Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms