Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms