Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHBQ15464 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHBQ15464 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHBQ15464 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms