Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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NECTIN1Q15223 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NECTIN1Q15223 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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