Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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