Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC3Q14003 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms