Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms