Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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