Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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