Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms