Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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