Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms