Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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