Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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