Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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