Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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BPTFQ12830 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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