Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms