Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD47Q08722 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD47Q08722 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms