Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms