Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms