Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms