Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms