Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms