Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms