Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ID3Q02535 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ID3Q02535 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms