Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms