Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms