Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms