Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM193AP78312 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms