Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms